论文查重软件在对论文结构进行检查时，主要从以下几个方面进行：1.文章结构合理性：查重软件会分析论文的章节安排、段落逻辑是否连贯，以及标题、摘要、正文、参考文献等部分的布局是否符合学术规范。2.内容完整性：检查论文内容是否完整，包括是否缺少必要的部分，如摘要、关键词、图表等。3.文章逻辑性：论文查重软件会分析论文各部分之间的逻辑关系是否清晰，是否存在表述不当或重复的问题。4.句法和语法规范性：软件会检查论文中的语法错误、拼写错误以及表达不准确的地方，提出修改建议。5.外部引用的准确性：检查论文中引用的外部资料是否准确，并对文献引用格式进行规范化。通过这些方面的检查，论文查重软件可以帮助作者全面了解论文结构的优缺点，提供优化建议，提高论文质量。

论文查重软件对论文结构的检查并非简单地对文字进行表面上的重复检测，而是通过深入分析论文的各个方面，发现并指出其中存在的问题，并提供相应的优化建议。具体来说，论文查重软件在检查论文结构时，会关注以下几个方面：1.逻辑结构是否严谨：包括文章的起承转合是否合理，论点是否清晰，论证是否有力等。2.表达是否清晰准确：检查文章的语言是否通顺，用词是否准确，是否存在歧义或模糊不清的表达。3.内容是否完整丰富：检查论文内容是否充实，是否涵盖了相关的理论、方法、实验和结论等方面。4.文献引用是否规范准确：检查引用的文献是否准确、完整，并且格式是否符合学术规范。5.格式是否规范统一：包括字体、字号、行距、段落缩进等格式是否符合要求。综上所述，论文查重软件对论文结构的检查不仅能够发现问题，还能够提供针对性的优化建议，有助于提高论文的质量和学术水平。